Вы говорите, что Президиум областного суда отказался рассматривать, что значит отказался рассматривать, оставил в силе, возвратил, отказал в передаче надзорной жалобы или что? Это важно.

Что кассается спора по существу, то врятли Вам кто-то профессионально сможет ответить на этот вопрос без изучения сути спора, т.к. установить обоснованность применения тех или иных норм процессуального или материального права, при котором неправильное их применение повлияло на исход дела, без детального изучения материалов дела не представляется возможным. Такую работу вполне возможно провести, однако уже на возмездной основе, если это Вам интересно, вышлем предложение.

О государственной пошлине по делам, рассматриваемым в судах общей юрисдикции см. ст.ст. 333.19, 333.20.

Совет: не ставьте ставку на "незначительные" процессуальные нарушения, которые принципиально не могли привести к неправильному решению как таковому. Тоже касается и применения норм материального права. Больше стоит обратить внимание на правильность расчета сумм, на правильность применения ОСН, на вопросы совмещения применения двух режимов налогообложения, в т.ч. по физлицам, занятым одновременно в разных видах деятельности и т.д., т.е. на тех аспектах и нормах, неправильное применение (толкование) которых привело к ошибкам суда.
В этом случае шансы есть, если же по формальным основаниям - не тратьте свое время!